[BioC] Regressions in multtest

Benjamin Otto b.otto at uke.uni-hamburg.de
Wed Jul 4 13:25:51 CEST 2007


Dear bioconductors,

How do I perform a simple linear regression with a permutation for pvalue
correction? I tried to use MTP with the command

>MTP(X=t(as.matrix(x)), Y=y, test="lm.YvsXZ", B=1)

where x and y are my two variable vectors. When I set the number of
iterations to 1 I get a NA call for my rawp and a warning message

>Warning message:
>no non-missing arguments to min; returning Inf

I the syntax above basically correct?

Best regards

Benjamin


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Benjamin Otto
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