[R] isoMDS error message!!! (fwd)

Andrea Rossetti rossetti at markov.stat.unipg.it
Wed Mar 1 10:48:55 CET 2000


uhps!!
I forgot to tell you that I'm running R 0.99.0 for windows32 on windows 95
osr2.

Thank you very much for the latest R-1.0.0 (even if I don't tried it 
yet)!!!

Andrea Rossetti
University of Perugia (Italy)
Statistical Science Department.
---------- Forwarded message ----------
Date: Tue, 29 Feb 2000 17:03:51 +0100 (MET)
From: Andrea Rossetti <rossetti at markov.stat.unipg.it>
To: r-help at stat.math.ethz.ch
Subject: [R] isoMDS error message!!!

Hi to all,

I do this

> valumod<-read.table("valu-medie.txt",header=T)
> library(mass)
> library(mva)
> valumod.x <- as.matrix(valumod)
> valumod.dist<-dist(valumod.x)
> valumod.mds <- isoMDS(valumod.dist)
Error in isoMDS(valumod.dist) : zero or negative distance between objects 2 and 4
>

Where is the error?

Andrea Rossetti.

PS I've attached the dataset.


-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-.-
r-help mailing list -- Read http://www.ci.tuwien.ac.at/~hornik/R/R-FAQ.html
Send "info", "help", or "[un]subscribe"
(in the "body", not the subject !)  To: r-help-request at stat.math.ethz.ch
_._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._._
-------------- next part --------------
	Ove_med	Mag_med	Cer_med	Max_med

1	2.25	2.75	2.75	2.25

2	2	3.25	2.5	2.25

3	1.75	2.75	2.5	3

4	2	3.25	2.5	2.25

5	2.25	2.25	2.25	3.25

6	1	3.25	3.25	2.5

7	2.5	3	2.5	2

8	2	2.75	2.5	2.75

9	2.5	2.5	3	2

10	2.75	1.5	2.75	3

11	3.25	2.25	1.25	3.25

12	2	1.75	2.75	3.5

13	1	2.25	4	2.75

14	2	2.25	3.5	2.25

15	2.25	2	2.5	3.25

16	2	2.25	2.5	3.25

17	1.75	2	2.75	3.5

18	2	2.25	3	2.75

19	2	2.25	3.25	2.5

20	1.75	2.5	3	2.75

21	3.25	1.75	2.25	2.75

22	2.5	1.5	2.25	3.75

23	2.25	2.5	2	3.25

24	1.5	2.25	3	3.25

25	2	3	2.25	2.75

26	1.75	2.5	2.25	3.5

27	1	2.5	3.25	3.25

28	2.25	2.25	2.5	3

29	2.25	2	3	2.75

30	2.25	2	3	2.75

31	1.75	2.75	2.25	3.25

32	3	2.75	1.75	2.5

33	2.75	2.5	2	2.75

34	2	2	3	3

35	2.5	1.5	3	3

36	3.5	1.75	2.5	2.25

37	2	2	2.25	3.75

38	2.25	2.25	2.25	3.25

39	1.5	2	2.75	3.75

40	1.5	2.5	3.25	2.75

41	1.25	2	2.75	4

42	2.5	2	2.25	3.25

43	3	2.25	2.75	2

44	1.75	3.25	1.5	3.5

45	2.75	3	2.25	2

46	2.75	2.75	2	2.5

47	2.25	3	2	2.75

48	2.5	2.75	2.5	2.25

49	2.5	2.25	2.5	2.75

50	1.75	3	2	3.25

51	1.5	3.5	2.25	2.75

52	2.25	3	1.25	3.5

53	2.5	1.25	3.5	2.75

54	1.75	2.5	3.25	2.5

55	2.25	3.5	1.75	2.5

56	2.5	3	2	2.5

57	2	3.5	1.5	3

58	2.5	3	2.25	2.25

59	2	3.25	3.25	1.5

60	1.25	2.75	3	3

61	2.25	2.25	2.75	2.75

62	2.5	3.25	1.5	2.75

63	2.5	2.75	2	2.75

64	1	2	3	4

65	2.5	2.5	2	3

66	2.75	3	1.25	3

67	2.75	2.25	2.25	2.75

68	2	2.5	2.75	2.75

69	2.75	3	1.25	3

70	1	2.75	2.25	4

71	1.25	3.25	2.75	2.75

72	1.75	2.75	1.75	3.75

73	2	2.5	2.25	3.25

74	2	3.25	1.75	3

75	2	2.75	2	3.25

76	3	2.25	2.25	2.5

77	2.5	2.5	2.5	2.5

78	2.25	2.25	2.5	3

79	1.5	2.25	2.75	3.5

80	1.75	3.75	3	1.5

81	2	2.75	2.5	2.75

82	2.25	3	2.25	2.5

83	2.25	3.5	1.75	2.5

84	2	3.5	1.5	3

85	3.75	1.75	2.5	2

86	2.25	3.25	1.75	2.75

87	2.5	1.5	2.75	3.25

88	2	2	3	3

89	4	1.75	1.75	2.5

90	3	3.25	2.25	1.5

91	2.5	3.5	1.75	2.25

92	2.75	2.5	3	1.75

93	1.75	2.75	3	2.5

94	2	3	1.75	3.25

95	2	1.75	3.5	2.75

96	1.75	3	2.5	2.75

97	2.25	2.5	2.75	2.5

98	2.25	2.25	2.5	3

99	2	2.75	1.75	3.5

100	1.75	3	2.5	2.75

101	2.5	2.75	2.25	2.5

102	1.75	3.25	2.25	2.75

103	2	2.75	2	3.25

104	1.5	2.75	2.75	3

105	3.5	1.5	2.25	2.75

106	2.5	3	1.75	2.75

107	2	3.25	1.5	3.25

108	2	2	2.75	3.25

109	1.25	2.5	3	3.25

110	1.75	2.75	2	3.5

111	2.25	3.75	2	2

112	1.75	3.5	1.75	3

113	1.75	2.5	2	3.75

114	1.75	1.75	2.75	3.75

115	1	4	2.5	2.5

116	2.5	2.25	2.75	2.5

117	1.75	1.75	3.25	3.25

118	2	2	3.25	2.75

119	1.5	3.25	2.75	2.5

120	1.75	4	1.5	2.75

121	2.25	2.75	2.5	2.5

122	2.75	1.75	2.75	2.75

123	1.75	3.5	2	2.75

124	2.5	2.5	1.5	3.5

125	2.75	1.75	2.5	3

126	2.25	2	3.25	2.5

127	1.75	2	2.25	4

128	2.5	3	2.25	2.25

129	2	3	2	3

130	2.5	2.5	2.5	2.5

131	2.5	2.25	1.75	3.5

132	1.75	2.75	1.75	3.75

133	2.25	1.75	2.75	3.25

134	1.75	4	2.25	2

135	2.5	2	2.25	3.25

136	2.5	2.5	1.5	3.5

137	2.25	1.75	2.75	3.25

138	2.5	2	2.75	2.75

139	2.5	3.25	1.75	2.5

140	2	3.25	2.25	2.5

141	2	3.25	1.75	3

142	2.5	2.25	2.25	3

143	2.5	3	1.5	3

144	2.5	2.25	2.5	2.75

145	3.25	3.5	1.5	1.75

146	2	2.75	2.75	2.5

147	2	2	2.5	3.5

148	2.25	2.75	2.25	2.75

149	2	1.5	3.25	3.25

150	1.75	2.25	2.5	3.5

151	3	1.75	2.25	3

152	1.75	2.5	2.75	3

153	2.25	2.25	2.5	3

154	2.5	2.5	2.25	2.75

155	2.75	2.25	2.25	2.75

156	1.5	2.75	2.5	3.25

157	2	3.75	1.75	2.5

158	2.25	3	2	2.75

159	2.25	2.5	2	3.25

160	2.75	2.75	2	2.5

161	2	2	3	3

162	2	2	3.25	2.75

163	1.75	3.5	2.25	2.5

164	2.25	2	2.5	3.25

165	2	2	3	3

166	3.25	2.5	2	2.25

167	2.5	3	2.25	2.25

168	2.25	1.5	3.75	2.5

169	2	2.5	2.25	3.25

170	2.25	3.25	2	2.5

171	1.75	2	3.25	3

172	2	3.25	2.5	2.25

173	3.5	2.25	1.75	2.5

174	3.25	2	2.25	2.5

175	3	1.75	2	3.25

176	3	1.75	3	2.25

177	2	2.5	2.75	2.75

178	2.5	2	2.25	3.25

179	1.75	4	2.75	1.5

180	2.25	1.75	3.25	2.75

181	2	3	2.75	2.25

182	2	2.75	2.5	2.75

183	1.75	2.75	2.25	3.25

184	3.25	2.5	2.5	1.75

185	2	1.75	3	3.25

186	1.75	2.25	3	3

187	2.5	2	2	3.5

188	1	2.75	3.25	3

189	2.5	3.25	1.5	2.75

190	2.5	2	2.75	2.75

191	2.25	2.75	2.5	2.5

192	1.75	1.75	2.5	4

193	2	2	2.5	3.5

194	1.75	2.5	2.5	3.25

195	1.5	2.5	2.5	3.5

196	2.5	1.5	2.25	3.75

197	2	2.25	2	3.75

198	2.25	1.5	4	2.25

199	1.75	2	2.5	3.75

200	2.5	2	3	2.5

201	1.75	2.25	2	4

202	3	2.5	2.75	1.75

203	2	2	3	3

204	2.25	2.5	2.5	2.75

205	2.75	2.5	2	2.75

206	1.75	3	1.5	3.75

207	1.75	2.75	2.75	2.75

208	2.5	3	2.75	1.75

209	2	3	1.75	3.25

210	1.25	2.5	3	3.25

211	2	3.25	2	2.75

212	2.25	2.25	2.5	3

213	2.25	1.25	3	3.5

214	1.75	2.5	2.5	3.25

215	2.25	2.25	2.25	3.25

216	2.5	2.25	2.5	2.75

217	2.75	2.5	3	1.75

218	3.25	2	1.75	3

219	2.5	2.75	1.75	3

220	2	2	2.75	3.25

221	2.75	2	2.25	3

222	2.5	2	3.25	2.25

223	2	2.5	2	3.5

224	2.25	2.75	2.25	2.75

225	1.5	3	2.25	3.25

226	2.25	2.25	2.75	2.75

227	2	2	2.75	3.25

228	2.5	2.5	2.5	2.5

229	2.25	3.25	2	2.5

230	2.5	2.25	2.75	2.5

231	2.25	2.25	2.5	3

232	2.5	1.5	2.25	3.75

233	2	3.25	2.5	2.25

234	2	3.25	2.5	2.25

235	2.75	2.75	2.25	2.25

236	2.75	3	2.25	2

237	1	2.5	3.5	3

238	2.25	3	2	2.75

239	1.5	3	2.25	3.25

240	2.5	2.75	2.5	2.25

241	2.5	2	2	3.5

242	1.25	3.25	2.5	3

243	2.5	2.25	2	3.25

244	2	3	2.5	2.5

245	2.25	4	1.5	2.25

246	2.5	4	2	1.5

247	2.5	2.5	2.25	2.75

248	2.75	3	2.25	2

249	2.75	3.25	2	2

250	1.5	4	2	2.5

251	2.5	2.75	2.5	2.25

252	3.5	2	2	2.5

253	2.5	3	2.5	2

254	2.25	2.75	2	3

255	2.5	2.5	2.25	2.75

256	1.75	2.5	2.75	3

257	2.75	1.75	2.75	2.75

258	2.5	3.25	2.5	1.75

259	2.75	3	1.5	2.75

260	2	2.5	2.25	3.25

261	1.25	3.5	2.75	2.5

262	2	2.75	2.5	2.75

263	2.75	2.25	2.25	2.75

264	2.5	2	2.75	2.75

265	2.75	1.75	2.25	3.25

266	2	2.25	2	3.75

267	2.5	1.75	2	3.75

268	3	2.5	2.5	2

269	1.75	1.75	3.25	3.25

270	3.25	2	2	2.75

271	3	2.25	2.5	2.25

272	2.25	3	3	1.75

273	2.5	2.75	1.75	3

274	2.25	2	2.25	3.5

275	1.75	1.75	2.75	3.75

276	2.5	2.5	2.5	2.5

277	2.25	2.25	2.5	3

278	2	2.25	3	2.75

279	1.75	2	3	3.25

280	2	3.25	3	1.75

281	2.75	1.5	2.5	3.25

282	2.25	3	2.5	2.25

283	3	2	2.5	2.5

284	2.25	3.25	1.5	3

285	3.25	2.25	2.25	2.25

286	1.5	3	2.5	3

287	1.75	3	3	2.25

288	2.25	2	2.75	3

289	1.75	3.25	2.75	2.25

290	2.25	2.25	2.5	3

291	2.25	2.75	2	3

292	2.75	3.75	2	1.5

293	3.25	2.25	1.5	3

294	1.25	1.75	3.75	3.25

295	1.25	2.25	2.75	3.75

296	2	3.75	2.5	1.75

297	2.5	3.25	1.75	2.5

298	2	3.75	1.75	2.5

299	1.25	2.5	2.5	3.75

300	1.5	2	3.75	2.75

301	3	2.75	2.5	1.75

302	2.75	2.75	2.75	1.75

303	2	2.25	2.75	3

304	2.5	2.5	3	2

305	1.5	2.5	2.75	3.25

306	2.5	3	2.25	2.25

307	1.75	2.75	2.25	3.25

308	2.75	1.75	2.5	3

309	2.75	2.5	2	2.75

310	2.75	1.5	2.75	3

311	2.5	2.5	2.25	2.75

312	3.25	2	2.75	2

313	2.5	4	2.25	1.25

314	2	3.25	2.5	2.25

315	1.75	2.5	2.5	3.25

316	1.5	3.25	2	3.25

317	2	1.5	2.75	3.75

318	2	1.5	2.75	3.75

319	1.75	2.5	2.75	3

320	2	2.25	3.25	2.5

321	2.25	2	3.25	2.5

322	1.75	2.5	3	2.75

323	2	2.75	3.25	2

324	3.25	1.75	2.75	2.25

325	1.75	2.25	3.5	2.5

326	2.5	2.75	2.25	2.5

327	2.5	2.5	2	3

328	2.25	1.75	2	4

329	2.5	2	3	2.5

330	2	2.5	2.5	3

331	2	2.5	2.5	3

332	2.5	2.5	3	2

333	2	3.75	2	2.25

334	2	3	1.75	3.25

335	2	2.25	3.25	2.5

336	1.75	3.5	2	2.75

337	1.5	3.25	1.75	3.5

338	2	3.5	1.5	3

339	2.75	1.75	2.25	3.25

340	1.25	3.75	2	3

341	2.5	2.5	3.25	1.75

342	2.75	2.5	1.75	3

343	3.5	3.5	1	2

344	2.5	2.5	2.5	2.5

345	1.75	2	3.5	2.75

346	1.75	2	3.5	2.75

347	1.75	3	2	3.25

348	2.5	2	3	2.5

349	2.75	3	2.75	1.5

350	2.5	3.25	1.75	2.5

351	1.75	2.5	2.5	3.25

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353	2.25	2	2.25	3.5

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